En 1936 el Doctor Jones es contratado por el gobierno estadounidense para localizar el "Arca de la Alianza", objeto sagrado buscado por los nazis para volverse invencibles según el Antiguo Testamento.
El arqueólogo René Belloq, enemigo de Jones, es contratado por los nazis para que los ayude a encontrar primero el codiciado objeto arqueológico.
Indy junto a Marion Ravenwood, hija de su mentor, logran encontrar el Arca en Egipto, pero los nazis los capturan y se quedan con ella.
Belloq realiza una ceremonia para abrir el arca, pero al hacerlo desatan la ira de Dios y todos mueren absorbidos por la fuerza sobrenatural contenidas en el interior del objeto.
Indiana y Marion sobreviven al místico poder y llevan la reliquia a los Estados Unidos.